Здесь проблем не должно быть. В предыдущем случае, как подсказал вам
teleport2222, была частота кадров исходника 29.970 фпс. При работе с такими исходниками лучше всегда делать pulldown до 23.976. Это одна из частых причин сбоя при кодировании на стадии сборки. Виртуалдаб отказывается муксить видео с аудиодорожкой. Конечно лучше всего кодировать без аудио, но при сборке может появится рассинхрон, которого не было в исходнике.