Если "на фоне", то убрать не получится, в этом случае дорожка одна.
Вообще же удалить составляющие файла из матроски можно с помощью
http://forum.kinozal.tv/showthread.php?t=20638
И по поводу записи, если вы скинете матроску на болванку, не факт, что железный плеер сможет прочесть запись.