Вообще это странно что файл update.exe не является вирусом, потому что после форматирования флешки, она не должна содержать вообще никаких файлов, а появление этих двух фалов, после подключения к компьютеру флеш свидетельствует о том что это какой-то троян (или что то в этом духе ) в системе поселился, я бы посоветовал Вам все таки проверить комп
Dr.Web® LiveCD, может попробовать прогнать в безопасном режиме
CureIt!®, вдруг чего нароет
У меня например такое было, когда зараза сидела на компьютере, форматиш флешку на другом (чистом) компе, подключаешь к инфицированному и сразу же под атрибутами скрытый два файлика autorun.inf и ******.ехе, правда еще одна папка создается recycler тоже как скрытая, а в ней файлик *****.ехе на который ссылается autorun.inf