Эта программа предназначена для обработки видео. Вы можете в ней из исходного файла сделать отдельный файл только с видео и отдельный файл: только звук. Последний можно обработать в любом аудиоредакторе, например Cool Edit, Adobe Audition или любом другом: удалить шумы, сделать нормализацию звука, преобразовать звук в псевдостерео и т.д. Единственное, что
нельзя делать - обрезать или вырезать куски - иначе при последующем совмещении с видео звук будет не синхронизирован. Потом опять в VirtualDub добавляете звук в видеофайл без звука. Во всех работах с видеофайлом на всех этапах для видео выбираете
Прямопотоковое копирование.