Даже 38. А быть может что угодно, нет смысла гадать.
Как бы я действовал.
Выставил в настройках ffdshow video OCD: Frame type,Current frame, Frame timestamps.
Растянул авишку средствами MKV Toolnix до 23.976.
Запустил параллельно два плеера.
Выбрал два одинаковых кадра где-то в начале фильма (лучше всего первые кадры после смены сцены, как правило - тип I).Записал номера кадров и время начала кадра с точностью до миллисекунд.
То же самое ближе к концу фильма.
Сравнил бы разницу.
Потом перемещался бы по фильму и искал точки перепада.
Зафиксировал начало и конец отсутствующих сцен.
Дальнейшие действия зависят от формата и канальности дорожек.
P.S. Как у Вас рассинхрон нарастает - постепенно или резко с каких-то мест?