Планировщик не включен?
Всётаки проверьте Windows Defender, не исключено, что он сканирует систему раз в сутки, к примеру в полночь, и соответственно находит программу, по его мнению, представляющую опасность.
Так же проверьтесь на зловредов.
Других идей не имею... Откат системы на крайний случай.