1) Или записать на BD, ели есть BD-RW на компе.
2) Ремукс - это не для обычных пользователей. Надо разбирать на потоки (eac3to или tsMuxer), потом собирать в mkv (mkvmerge). Поэтому этот способ отпадает. К тому же, теряется управление из меню, доп. материалы и пр.