Скачивая торрент-файлы Вы указываете какую-то папку, загляните туда, они должны быть на месте (конечно, это зависит от настроек Вашей программы) и заново их качать не придётся, просто, при запуске какой-либо раздачи, укажите место в которой она находится (фильм или музыка) и после проверки программа должна начать раздавать.
Взгляните на это окно настроек и найдёте свои торрент-файлы (у меня тут все настройки отключены, я по своему сортирую файлы)